La faune et la flore du Guatemala sont tout aussi diverses que sa géographie. Sur la côte du Pacifique, vous pourrez observer de nombreuses espèces de tortues, particulièrement au Biotopo Monterrico-Hawaii. Ici les tortues viennent déposer leurs œufs à des époques précises de l'année.
Tout près, les mangroves s'étendent sur les berges des rivières prenant leur source des hautes montagnes. Puis il suffit de monter un peu en altitude vers l'intérieur du pays pour pouvoir observer de nombreuses espèces d'orchidées et de champignons.
Le quetzal, l'oiseau mythique des Mayas, vit dans les montagnes des Hautes Terres. Cet oiseau rare, au long plumage flamboyant, peut être observé, avec beaucoup de patience ou de chance dans le Biotopo del Quetzal. Les grandes forêts de cette région sont prisées de l'industrie forestière qui s'y est établie depuis le début du siècle.
Ce sont pourtant les jungles du Petén, très fréquentées par les voyageurs grâce à la présence des ruines de Tikal, qui façonneront davantage l'imaginaire des aventuriers contemporains. A perte de vue, elles occupent presque le tiers de tout le territoire guatémaltèque. Ici les toucans, les perroquets et les colibris nichent dans les forêts d'acajous, d'avocatiers et de ceibas, l'arbre légendaire et mythique des Mayas.
Il n'y a pas que les oiseaux qui peuplent cette énorme jungle tropicale. De multiples mammifères, tel les singes crieurs, les ocelots, les pumas, les tapirs, les renards roux et bien d'autres, ont choisi de vivre à l'ombre de ces grands arbres.
La côte caraïbe du Guatemala n'est pas en reste en ce qui concerne les richesses naturelles qu'on y trouve. Les récifs de corail de ces mers paisibles sont le refuge de nombre d'espèces de poissons, mais aussi de requins, de tortues et de crocodiles d'eau salée. On pourra aussi y observer le lamantin.